200 godina nakon svoje smrti Ellen Ripley (S. Weaver) ponovno oživljava zahvaljujući timu stručnjaka koji uz pomoć uzorka krvi kloniraju novu Ripley.

Kako bi se domogli kraljice aliena naučnici kreiraju klon Ellen Ripley, osobe u kojoj se nalazio embrio. Nakon što uspešno izvuku kraljicu naučnici odluče zadržati Ripley za daljnje proučavanje a kraljicu koriste kako bi proizvodila jaja. Zbog mešanja alienske i ljudske DNA Ripley je razvila nadljuske sposobnosti. Betty, brod pun plaćenika, donosi materijal za eksperimente, ljude.

Plaćenici susreću Ripley i njihov najmlađi član, Call, je pokušava ubiti jer se boji da će Ripley stvoriti novo leglo aliena. No Call je zakasnila jer su alieni već stvoreni te ubrzo pobegnu iz zatočeništva, pobiju većinu posade i oštete brod. Jedan od naučnika, Dr. Wren, otkriva da u slučaju oštećenja, brod biva automatski usmjeren prema Zemlji. Shvaćajući šta bi alieni napravili kad bi se domogli cele planete pune ljudi, plaćenici i Ripley će pokušati da pobegnu i unište brod smrti koji nezaustavljivo juri prema Zemlji...

Po mišljenju mnogih kritičara ovaj je film najslabiji deo serijala, koji ipak zaslužuje pažnju kao (zasad) završni deo celine, te zbog snažnog osjećaja za vizualno.